La recerca del grup Cancer Data Science (CaDS) està dedicada a aprofundir en la comprensió de la complexitat del càncer, tant des d'un punt de vista de les bases de la malaltia com del seu tractament, mitjançant l'anàlisi computacional i la integració de conjunts de dades moleculars a gran escala. Més específicament, actualment estem centrant els esforços en: dotar els actuals tractaments en càncer d'un component més personalitzat mitjançant l'ús de metodologies computacionals; determinar les bases moleculars de la malatia en pacients joves; o determinar la genealogia evolutiva de les cèl•lules tumorals mitjançant anàlisis bioinformàtiques. En el grup CaDS també hem desenvolupat aplicacions bioinformàtiques d'èxit com l'SNPStats, i col•laborem amb múltiples grups de la nostra institució, així com amb altres grups de recerca nacionals i internacionals.
BIOLOGIA COMPUTACIONAL DE CÀNCER, BIOINFORMÀTICA, MEDICINA DE PRECISIÓ, BIOLOGIA DE SISTEMES / XARXES, LA INTEGRACIÓ DE DADES BIOLÒGIQUES, LES VIES DE SENYALITZACIÓ I BIOLOGIA MOLECULAR, ANÀLISI DE DADES DE SEQÜENCIACIÓ DE NOVA GENERACIÓ (NGS), APRENENTATGE AUTOMÀTIC, EPIDEMIOLOGIA GENÈTICA, ESTUDIS D'ASSOCIACIÓ, BIOMARCADORS DEL CÀNCER I SUSCEPTIBILITAT
FORMACIÓ
2012 – Doctorat en Medicina, Universitat de Barcelona (UB), Barcelona
2003 – Màster en Genètica, Universitat de Barcelona (UB), Barcelona
2001 – Llicenciat en Ciencies Informàtiques, Universitat Politècnica de Catalunya (UPC), Barcelona.
EXPERIÈNCIA PROFESSIONAL
2017 – actual: Professor col·laborador del Màster en Investigació Clínica, Bioestadística I, Universitat Internacional de Catalunya (UIC), Barcelona
2016 – actual: Líder del Grup de Dades del Càncer Ciència (CaDS), Programa de Prevenció i Control del Càncer, Institut Català d’Oncologia (ICO), Barcelona
2012 – 2016: Associat de recerca post-doctoral al Laboratori de Sridhar Ramaswamy, Massachusetts General Hospital Cancer Center / Harvard Medical School / Broad Institute of MIT & Harvard, Boston, EUA
2008: Científic visitant al Laboratori d’Andrea Califano. Centre de Biologia Computacional i Bioinformàtica (C2B2), Universitat de Columbia, Nova York, EUA
2008 – 2012: Bioinformàtic, Unitat de Biomarcadors i Susceptibilitat, Institut Català d’Oncologia (ICO), Barcelona
2001 – 2007: Bioinformàtic, Servei d’Epidemiologia i Registre del Càncer, Institut català d’Oncologia (ICO), Barcelona
ALTRES
Premis i distincions:
- Beca Postdoctoral: Borses d’Ampliació d’Estudis (BAE), Acció Estratègica de Salut. Institut de Salut Carlos III, Ministeri d’Economia i Competitivitat de Espanya (2012).
- Beca de Formació: YAMAGIWA-Yoshida Memorial beca d’estudis Internacional, la Unió Internacional Contra el Càncer (2008).
- Beca de Formació: Agència Català de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR) Beques de Viatge. Disminuït a causa de la incompatibilitat amb una altra finançament concedit (2008).
Presentacions seleccionades en reunions nacionals i internacionals:
- Novembre 2016: Solé X, Salony, Alves CP, Dey-Guha I, Ritsma L, Boukhali M, Lee JH, Chowdhury J, Ross KN, Haas W, Vasudevan S, Ramaswamy S. AKT Inhibition Promotes Non-autonomous Cancer Cell Survival. 1st PMPPC Conference: Personalized Cancer Medicine in the Age of Aging, Barcelona (Spain). Presentació oral.
- Octubre 2016: Solé X, Salony, Alves CP, Dey-Guha I, Ritsma L, Boukhali M, Lee JH, Chowdhury J, Ross KN, Haas W, Vasudevan S, Ramaswamy S. AKT Inhibition Promotes Non-autonomous Cancer Cell Survival. 15th CRG Symposium: Evolution and Medicine, Barcelona (Spain). Presentació oral.
- Abril 2016: Solé X, Salony, Alves CP, Dey-Guha I, Ritsma L, Boukhali M, Lee JH, Chowdhury J, Ross KN, Haas W, Vasudevan S, Ramaswamy S. AKT Inhibition Promotes Non-autonomous Cancer Cell Survival. MGH SAC 2016, Boston (USA). Poster.
- Octubre 2011: Solé X, Cordero D, Crous-Bou M, Sanz R, Berenguer A, Moreno V. Master Regulators of Metastasis in Early Stage Colon Cancer. 6th Annual DREAM on Reverse Engineering Challenges, 7th Annual RECOMB Satellite on Systems Biology, 8th Annual RECOMB Satellite on Regulatory Genomics & 1st IDIBELL Conference on Cancer Informatics (RICCI), Barcelona (Spain). Presentació oral.
Afiliacions i altres contribucions científiques
– 2002 – actual: Membre de “International Society for Computational Biology” ISCB.
– 2009 – actual: UICC Yamagiwa-Yoshida revisor de subvenció.
– 2010 – actual: Membre de “New York Academy of Sciences” (NYAS).
– 2008 – actual: Revisor para BMC Bioinformatics, BMC Cancer, BMC Medical Genomics .
PUBLICACIONS SELECCIONADES
JARID1B Enables Transit between Distinct States of the Stem-like Cell Population in Oral Cancers.
Facompre ND, Harmeyer KM, Solé X, Kabraji S, Belden Z, Sahu V, Whelan K, Tanaka K, Weinstein GS, Montone KT, Roesch A, Gimotty PA, Herlyn M, Rustgi AK, Nakagawa H, Ramaswamy S, Basu D. Cancer Res. 2016 Sep 15;76(18):5538-49. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3377. Epub 2016 Aug 3. PMID: 27488530.
AKT Inhibition Promotes Nonautonomous Cancer Cell Survival.
Salony*, Solé X*, Alves CP, Dey-Guha I, Ritsma L, Boukhali M, Lee JH, Chowdhury J, Ross KN, Haas W, Vasudevan S, Ramaswamy S. Mol Cancer Ther. 2016 Jan;15(1):142-53. doi: 10.1158/1535-7163.MCT-15-0414. Epub 2015 Dec 4. PMID: 26637368
Large differences in global transcriptional regulatory programs of normal and tumor colon cells.
Cordero D*, Solé X*, Crous-Bou M, Sanz-Pamplona R, Paré-Brunet L, Guinó E, Olivares D, Berenguer A, Santos C, Salazar R, Biondo S, Moreno V. BMC Cancer. 2014 Sep 24;14:708. doi: 10.1186/1471-2407-14-708. PMID: 25253512
Discovery and validation of new potential biomarkers for early detection of colon cancer.
Solé X*, Crous-Bou M*, Cordero D*, Olivares D, Guinó E, Sanz-Pamplona R, Rodriguez-Moranta F, Sanjuan X, de Oca J, Salazar R, Moreno V. PLoS One. 2014 Sep 12;9(9):e106748. doi: 10.1371/journal.pone.0106748. eCollection 2014 Sep 12. PMID: 25215506
Reverse engineering of TLX oncogenic transcriptional networks identifies RUNX1 as tumor suppressor in T-ALL.
Della Gatta G, Palomero T, Perez-Garcia A, Ambesi-Impiombato A, Bansal M, Carpenter ZW, De Keersmaecker K, Solé X, Xu L, Paietta E, Racevskis J, Wiernik PH, Rowe JM, Meijerink JP, Califano A, Ferrando AA. Nat Med. 2012 Feb 26;18(3):436-40. doi: 10.1038/nm.2610. PMID: 22366949
