En este trabajo, se han analizado, por medios computacionales, la relación entre cambios en el número de copias del ADN (“copy number aberrations”) y la variación en la expresión génica en nuestras muestras de Colonomics. Como novedad respecto a otros trabajos, se ha tenido en cuenta el componente estromal de la muestra. Además, se realizó un sub-estudio categorizando las muestras analizadas según su subtipo CMS.  Se encontró una gran heterogeneidad de alteraciones entre muestras. Además, estas aberraciones en número de copia tienen un gran impacto en la expresión génica y contribuyen en gran manera a desregular vías de señalización relevantes en cáncer de colon. Finalmente, creemos que es importante considerar la pureza del tumor para poder calcular de una manera precisa los cambios de número de copia en muestras tumorales, dada la naturaleza diploide de las células estromales infiltrantes.

El artículo fue publicado en el British Journal of Cancer, con Ma Henar Alonso como autor principal.

 

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28683472

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